MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MW2

Total Repeats: 55445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003923	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281730
2	NC_003923	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281730
3	NC_003923	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281730
4	NC_003923	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281730
5	NC_003923	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
6	NC_003923	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281730
7	NC_003923	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281730
8	NC_003923	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281730
9	NC_003923	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	21281730
10	NC_003923	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281730
11	NC_003923	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281730
12	NC_003923	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	21281730
13	NC_003923	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	21281730
14	NC_003923	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281730
15	NC_003923	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281730
16	NC_003923	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281730
17	NC_003923	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281730
18	NC_003923	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281730
19	NC_003923	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
20	NC_003923	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21281730
21	NC_003923	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
22	NC_003923	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281730
23	NC_003923	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21281730
24	NC_003923	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
25	NC_003923	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
26	NC_003923	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21281730
27	NC_003923	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	21281730
28	NC_003923	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	21281730
29	NC_003923	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281730
30	NC_003923	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281730
31	NC_003923	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	21281730
32	NC_003923	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	21281730
33	NC_003923	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	21281730
34	NC_003923	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
35	NC_003923	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281730
36	NC_003923	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	21281730
37	NC_003923	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	21281730
38	NC_003923	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
39	NC_003923	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281730
40	NC_003923	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	21281731
41	NC_003923	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
42	NC_003923	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
43	NC_003923	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281731
44	NC_003923	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281731
45	NC_003923	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281731
46	NC_003923	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	21281731
47	NC_003923	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	21281731
48	NC_003923	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	21281731
49	NC_003923	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
50	NC_003923	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	21281731
51	NC_003923	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	21281731
52	NC_003923	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	21281731
53	NC_003923	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281731
54	NC_003923	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281731
55	NC_003923	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	21281731
56	NC_003923	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281731
57	NC_003923	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21281731
58	NC_003923	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	21281731
59	NC_003923	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
60	NC_003923	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281731
61	NC_003923	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	21281731
62	NC_003923	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
63	NC_003923	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281731
64	NC_003923	AAC	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281731
65	NC_003923	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281731
66	NC_003923	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281731
67	NC_003923	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281731
68	NC_003923	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21281731
69	NC_003923	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281731
70	NC_003923	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281731
71	NC_003923	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	21281731
72	NC_003923	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	21281731
73	NC_003923	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	21281731
74	NC_003923	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281731
75	NC_003923	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281731
76	NC_003923	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21281731
77	NC_003923	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281731
78	NC_003923	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	21281731
79	NC_003923	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281732
80	NC_003923	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281732
81	NC_003923	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281732
82	NC_003923	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281732
83	NC_003923	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281732
84	NC_003923	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	21281732
85	NC_003923	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	21281732
86	NC_003923	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	21281732
87	NC_003923	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281733
88	NC_003923	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	21281733
89	NC_003923	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281733
90	NC_003923	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	21281733
91	NC_003923	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281733
92	NC_003923	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21281733
93	NC_003923	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281733
94	NC_003923	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281733
95	NC_003923	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281733
96	NC_003923	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	21281733
97	NC_003923	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281733
98	NC_003923	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281733
99	NC_003923	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281733
100	NC_003923	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281733
101	NC_003923	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281733
102	NC_003923	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281733
103	NC_003923	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281733
104	NC_003923	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281733
105	NC_003923	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281733
106	NC_003923	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21281734
107	NC_003923	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	21281734
108	NC_003923	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	21281734
109	NC_003923	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281734
110	NC_003923	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	21281734
111	NC_003923	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281734
112	NC_003923	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	21281734
113	NC_003923	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281734
114	NC_003923	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	21281734
115	NC_003923	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281734
116	NC_003923	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281734
117	NC_003923	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	21281734
118	NC_003923	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281734
119	NC_003923	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	21281734
120	NC_003923	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281734
121	NC_003923	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281734
122	NC_003923	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	21281734
123	NC_003923	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281734
124	NC_003923	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281734
125	NC_003923	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281734
126	NC_003923	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281734
127	NC_003923	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281734
128	NC_003923	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281734
129	NC_003923	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281734
130	NC_003923	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	21281734
131	NC_003923	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281734
132	NC_003923	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281734
133	NC_003923	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21281734
134	NC_003923	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281734
135	NC_003923	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	21281734
136	NC_003923	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281734
137	NC_003923	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281734
138	NC_003923	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	21281734
139	NC_003923	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	21281734
140	NC_003923	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	21281734
141	NC_003923	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281734
142	NC_003923	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21281734
143	NC_003923	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281734
144	NC_003923	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	21281734
145	NC_003923	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	21281734
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147	NC_003923	TGT	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281734
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150	NC_003923	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281735
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152	NC_003923	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	21281735
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159	NC_003923	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	21281735
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161	NC_003923	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	21281735
162	NC_003923	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21281735
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164	NC_003923	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	21281735
165	NC_003923	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281735
166	NC_003923	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281735
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174	NC_003923	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281735
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180	NC_003923	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21281735
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186	NC_003923	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281735
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244	NC_003923	TAT	2	6	11024	11029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281737
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249	NC_003923	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21281737
250	NC_003923	T	6	6	11262	11267	0 %	100 %	0 %	0 %	21281737
251	NC_003923	TAT	2	6	11279	11284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281737
252	NC_003923	CT	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	21281737
253	NC_003923	TAGCAT	2	12	11347	11358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21281737
254	NC_003923	GAA	2	6	11391	11396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281737
255	NC_003923	AAG	2	6	11455	11460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281737
256	NC_003923	TA	3	6	11514	11519	50 %	50 %	0 %	0 %	21281737
257	NC_003923	AGA	2	6	11525	11530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281737
258	NC_003923	TGC	2	6	11555	11560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281737
259	NC_003923	ATG	2	6	11605	11610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281737
260	NC_003923	ACG	2	6	11688	11693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281737
261	NC_003923	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	21281737
262	NC_003923	AATG	2	8	11804	11811	50 %	25 %	25 %	0 %	21281737
263	NC_003923	GGT	2	6	11868	11873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21281737
264	NC_003923	ATC	2	6	11908	11913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21281737
265	NC_003923	CGT	2	6	11952	11957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281737
266	NC_003923	GAT	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281737
267	NC_003923	TGC	3	9	12053	12061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281737
268	NC_003923	AAG	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281737
269	NC_003923	GCT	2	6	12162	12167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21281737
270	NC_003923	ATT	2	6	12183	12188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281737
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273	NC_003923	GAG	2	6	12291	12296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21281737
274	NC_003923	CCAT	2	8	12312	12319	25 %	25 %	0 %	50 %	21281737
275	NC_003923	CAAT	2	8	12375	12382	50 %	25 %	0 %	25 %	21281737
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387	NC_003923	TAGA	2	8	18701	18708	50 %	25 %	25 %	0 %	21281743
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389	NC_003923	ATT	2	6	18852	18857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281743
390	NC_003923	ATGA	2	8	18889	18896	50 %	25 %	25 %	0 %	21281743
391	NC_003923	TCAAT	2	10	18914	18923	40 %	40 %	0 %	20 %	21281743
392	NC_003923	TTA	2	6	18935	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281743
393	NC_003923	AT	3	6	18962	18967	50 %	50 %	0 %	0 %	21281743
394	NC_003923	A	6	6	19013	19018	100 %	0 %	0 %	0 %	21281743
395	NC_003923	AGA	2	6	19032	19037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21281743
396	NC_003923	A	6	6	19070	19075	100 %	0 %	0 %	0 %	21281743
397	NC_003923	TTGGTG	2	12	19109	19120	0 %	50 %	50 %	0 %	21281743
398	NC_003923	GCA	2	6	19378	19383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281743
399	NC_003923	GT	3	6	19388	19393	0 %	50 %	50 %	0 %	21281743
400	NC_003923	ATG	2	6	19405	19410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281743
401	NC_003923	AAT	2	6	19411	19416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21281743
402	NC_003923	ACG	2	6	19464	19469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21281743
403	NC_003923	TGA	2	6	19472	19477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281743
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405	NC_003923	TTA	2	6	19514	19519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21281743
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410	NC_003923	GTT	2	6	19633	19638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281743
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430	NC_003923	A	6	6	20436	20441	100 %	0 %	0 %	0 %	21281744
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432	NC_003923	TTGAAG	2	12	20509	20520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21281744
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497	NC_003923	ATGTA	2	10	23651	23660	40 %	40 %	20 %	0 %	21281746
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499	NC_003923	AACA	2	8	23695	23702	75 %	0 %	0 %	25 %	21281746
500	NC_003923	GTT	2	6	24942	24947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21281747

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